מאגר מים בבניין הוא מיכל או מערכת אגירה המשמשים לאחסון מים לשימושים שונים בבניין – לרוב למטרות שתייה, רחצה, ניקיון, ולעיתים גם לצרכים תעשייתיים או כיבוי אש.
מדובר ברכיב חיוני במיוחד בבנייני מגורים משותפים, בנייני משרדים, מוסדות חינוך ובריאות, ומבנים ציבוריים. מאגרי המים ממוקמים בדרך כלל בגג הבניין (מאגר עליון) או במרתף (מאגר תחתון), בהתאם לתכנון ההנדסי ולדרישות התחזוקה.

תפקידו המרכזי של מאגר המים הוא להבטיח אספקת מים סדירה ויציבה לכל דיירי הבניין, גם בשעות עומס או במקרים של תקלות זמניות באספקת המים מהתאגיד העירוני.
לעיתים המאגר מחובר למערכת הגברת לחץ (משאבות מים) שנועדה לווסת את הלחץ ולספק מים לקומות הגבוהות בבניין.

המאגר חייב לעמוד בתקנים מחמירים של משרד הבריאות ורשויות המים, כולל שימוש בחומרים בטוחים, סגירה הרמטית שמונעת חדירת מזהמים, ומערכת ניקוז המונעת הצטברות מים עומדים. תחזוקה שוטפת וניקוי תקופתי של המאגר חיוניים להבטחת איכות המים, מניעת התפתחות חיידקים כמו ליגיונלה, ושמירה על בריאות דיירי הבניין.

בבניינים חדשים, לרוב מותקנים מאגרים כחלק אינטגרלי ממערכת המים של המבנה.
בבניינים ישנים, לעיתים נדרש שדרוג או החלפה של המאגרים הקיימים כדי לעמוד בדרישות התקן העדכניות. בעלי בתים משותפים והוועדים נושאים באחריות לבדיקה תקופתית, ניקיון וטיפול בתקלות, ולעיתים נעזרים באנשי מקצוע מוסמכים שמבצעים את התחזוקה והבדיקות.